Assistant-e ingénieur-e en virologie chez INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

L’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation (M.A.) (www.envt.fr).

L’Etablissement a Pour Mission Première La Formation Des Vétérinaires (150 Diplômés Par An) Dans Le Cadre D’un Référentiel De Formation National Qu’il Se Doit De Respecter. L’Ecole Est Accréditée Par L’Association Européenne Des Etablissements Vétérinaires (AEEEV) Et Donc Soumise Au Respect Des Normes De Cette Association. Les Équipes D’enseignants Sont Regroupées Au Sein De Trois Départements

• Elevage et produits/Santé publique vétérinaire,
• Sciences biologiques et fonctionnelles,
• Sciences cliniques des animaux de compagnie, de sport et de loisirs.

En matière de recherche, l’Etablissement accueille plusieurs équipes de scientifiques (la plupart sont des UMR avec une cotutelle INRAE, INSERM, UPS, …) en lien avec la santé animale, l’hygiène des aliments ou la génétique.

L’UMR ENVT-INRAE IHAP (Interactions Hôtes Agents Pathogènes) est une unité pluridisciplinaire qui conduit des recherches sur les maladies infectieuses animales d’importance prioritaire pour la santé de l’animal et la santé publique, dans une approche « une seule santé ». Cette unité couvre différents types d’agents pathogènes (virus, bactéries, parasites), d’hôtes (ruminants, volailles, modèles rongeurs, faune sauvage, …) et d’échelles. L’unité compte deux équipes de recherche en virologie : l’équipe VIRAL et l’équipe VIRéMIE. La personne recrutée évoluera dans l’équipe VIRéMIE, dont le cœur des activités de recherche est basé sur l’étude des virus influenza aviaires. Les membres de l’équipe cherchent à comprendre les mécanismes évolutifs de ces virus et les implications possibles de ces mécanismes sur la pathogénicité, l’échappement immunitaire ou le franchissement de la barrière d’espèce. L’équipe travaille également à la caractérisation moléculaire et antigénique de virus influenza A qui circulent à l’étranger, à travers des activités de surveillance, à des fins d’analyse de risque pour la santé animale et la santé publique à l’échelle internationale.

L’objectif de ce recrutement est de renforcer l’équipe sur le projet AVIFLU-REACT, un projet financé par l’institut Carnot, qui se fait en collaboration entre l’équipe VIRéMIE, dirigée par le Dr. Mariette Ducatez et basée à Toulouse, et l’équipe du Dr. Nadia Naffakh à l’institut Pasteur de Paris. L’objectif de ce projet et d’améliorer les capacités de détection de différents variants en co-circulation à partir de prélèvements biologiques et environnementaux, et réaliser une analyse de risque quant à leurs possibilités d’évolution. La personne sera principalement en charge de réaliser des co-infections en système cellulaire avec différentes souches virales et d’optimiser un protocole de concentration de virus infectieux dans des matrices environnementales.

• Microbiologie :
• Virologie cellulaire : isolement de souches virales, amplification virale sur œufs ou sur cellules, réalisation de titrage virologiques en TCID50 ou en plages de lyse, infections expérimentales.
• Virologie moléculaire : mise en œuvre de l’extraction d’acides nucléiques et des tests moléculaires (PCR conventionnelle et en temps réel, séquençage), électrophorèse sur gel.
• Manipulation de virus en laboratoire confiné de niveau 2 (BSL2) et formation à la manipulation des virus en environnement confiné de niveau de 3 (BSL3).
• Missions transversales d’appui logistique au laboratoire de virologie :
• Appliquer en situation de travail les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et sécurité, et celles spécifiques à la manipulation de certains produits ou agents infectieux.
• Participer à la gestion des stocks et des commandes.
• Activités de formation et d’encadrement des étudiants et des stagiaires :
• Accompagnement des stagiaires et d’étudiants vétérinaire réalisant leur thèse d’exercice vétérinaire.
• Accompagnement des étudiants en stage de master et doctorants en thèse de 3ème cycle et personnel occasionnel.
• Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires (bonnes pratiques de laboratoire, règles d’hygiènes et sécurité).
• Activités de communication scientifique :
• Communication des résultats obtenus à l’écrit ou à l’oral lors de réunions de projet.

Présence sur site, travail en environnement confiné

Formations et compétences recherchées

BTS/DUT (Bac+2)

Savoirs

• Biologie cellulaire
• Biologie moléculaire
• Infectiologie
• Lecture et écriture scientifique

Savoir-faire

• Prise en charge d’échantillons biologiques
• Réalisation de manipulations de routine en biologie moléculaire (extraction d’acide nucléique, réalisation de PCR classique et en temps réel)
• Réalisation de manipulations de virologie cellulaire
• Rédaction de rapports, de communications et de publications
• Prise de parole lors de réunions de projet

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

• jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• d’un soutien à la parentalité : CESU garde d’enfants, prestations pour les loisirs ;
• de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• d’un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
• d’activités sportives et culturelles ;
• d’une restauration collective.

Modalités pour postuler

J’envoie mon CV et ma lettre de motivation

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.

> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr