Chargé-e de recherche en stratégie de sélection génétique chez INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche rassemblant une communauté de 12 000 personnes, réparties dans 272 unités de recherche, de service et d’expérimentation implantées sur 18 centres sur toute la France.

Institut de recherche finalisée, il est le premier organisme de recherche mondial spécialisé sur l’ensemble « agriculture-alimentation-environnement ». INRAE a pour ambition d’être un acteur clé des transitions nécessaires pour répondre aux grands enjeux mondiaux.

Face à l’augmentation de la population et au défi de la sécurité alimentaire, au dérèglement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, l’institut a un rôle majeur pour construire des solutions et accompagner la nécessaire accélération des transitions agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Vous intégrerez l’unité mixte de recherche Génétique Physiologie et Système d’élevage (GenPhySE, 148 permanents), dont les recherches visent à contribuer à la transition agroécologique des systèmes d’élevage par une meilleure compréhension de la biologie des animaux d’élevage, du déterminisme génétique des caractères et des stratégies de sélection de populations animales résilientes. L’unité réunit des compétences en biologie, physiologie, génomique, génétique, statistiques et bioinformatique.

Au sein de cette unité, vous rejoindrez l’équipe Stratégies Génétiques pour la Multiperformance des Systèmes d’Elevage, qui modélise et conçoit de nouvelles stratégies de sélection pour des petits ruminants, porcs et lapins adaptés au changement global. Le changement climatique et les nouvelles demandes sociétales nécessitent de faire évoluer les systèmes d’élevage en accord avec les principes de la transition agroécologique. Vous aurez en charge de proposer des méthodes innovantes d’organisation de programmes de sélection pour que les populations animales soient adaptées aux nouvelles conditions d’élevage tout en réduisant leur empreinte environnementale. Vous appréhenderez la recherche de solutions selon différentes échelles, allant de l’animal à l’ensemble de son système de production.

A l’échelle de l’animal, vous identifierez les stratégies optimales répondant simultanément aux enjeux économiques, environnementaux et sociétaux. Vous envisagerez des approches alternatives à la multiplication des caractères, parfois antagonistes, à inclure dans les objectifs de sélection. Ainsi, vous explorerez, par exemple, les bénéfices de stratégies basées sur des compromis entre caractères, la sélection modulaire, ou encore la recherche de parcimonie. De plus, vous étudierez l’intérêt d’intégrer à la sélection les impacts environnementaux globaux ou locaux, et sociétaux. Cela pourra passer par l’introduction d’indicateurs spécifiques (comme les émissions de méthane, le potentiel d’eutrophisation des eaux, ou le bien-être animal) ou la définition de pondérations environnementales et sociétales dans l’objectif de sélection. Vous vous appuierez pour cette étape sur les connaissances de la variabilité génétique des caractères et de leurs interrelations étudiées dans les autres équipes de l’unité. Vous explorerez le potentiel que représentent les ressources génétiques disponibles dans les réservoirs génétiques extérieurs à la population cible (introgression, schémas récursifs, gestion de la diversité…). Cela vous amènera à réfléchir à l’utilisation du croisement dans les schémas de sélection, que ce soit de manière ponctuelle, systématique ou pour la création de nouvelles populations synthétiques.

A l’échelle du système, vous examinerez le potentiel d’autres stratégies reposant sur la complémentarité au sein du système. Vous pourriez ainsi explorer la possibilité d’une sélection permettant de regrouper au sein d’un même troupeau des sous-populations sélectionnées selon des objectifs distincts assurant leur complémentarité. Ce raisonnement pourra être conduit intra-espèce, inter-espèce voire inter-règne pour des échelles supérieures. Enfin, il sera attendu que vous proposiez des stratégies capables d’anticiper et de s’adapter aux évolutions des environnements de production, notamment par l’utilisation de pondérations dynamiques. Cela demande, entre autres, d’intégrer finement les interactions entre éléments du système (plante-animal, entre espèces…) dans la conception des stratégies de sélection.

Formations et compétences recherchées

Doctorat ou équivalent

Titulaire d’un doctorat (ou équivalent), vous devrez justifier de bases solides en génétique quantitative et de bonnes connaissances en théorie de la sélection.

La maitrise d’outils en statistique et bio-informatique pour travailler avec de très grands jeux de données et réaliser des simulations stochastiques sont attendues. Des connaissances en agronomie et un intérêt pour l’élevage seraient appréciés.

La maîtrise de l’anglais est souhaitée ainsi qu’une expérience internationale de longue durée : les lauréats qui n’en auraient pas encore eu devront réaliser un séjour à l’étranger à l’issue de l’année de stage.

Votre qualité de vie à INRAE

En Rejoignant INRAE, Vous Bénéficiez

• de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• d’un soutien à la parentalité : CESU garde d’enfants, prestations pour les loisirs ;
• de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• d’un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
• d’activités sportives et culturelles ;
• d’une restauration collective.

Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE

Modalités pour postuler

• Je télécharge le guide Guide des candidats CRCN 2025 pdf – 3.72 MB
• Je note le numéro du profil CR-2025-GA-2
• Je m’inscris Inscription

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr