Chargé-e de recherche en biologie intégrative de la xylogenèse chez INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche rassemblant une communauté de 12 000 personnes, réparties dans 272 unités de recherche, de service et d’expérimentation implantées sur 18 centres sur toute la France.

Institut de recherche finalisée, il est le premier organisme de recherche mondial spécialisé sur l’ensemble « agriculture-alimentation-environnement ». INRAE a pour ambition d’être un acteur clé des transitions nécessaires pour répondre aux grands enjeux mondiaux.

Face à l’augmentation de la population et au défi de la sécurité alimentaire, au dérèglement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, l’institut a un rôle majeur pour construire des solutions et accompagner la nécessaire accélération des transitions agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

L’UMR BioForA (Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt) porte un projet scientifique dont l’objectif est la valorisation des ressources génétiques forestières pour la production durable de bois dans un contexte climatique changeant. BioForA rassemble des compétences en physiologie, génétique et génomique pour comprendre l’architecture génétique de caractères complexes spécifiques aux arbres et mieux prédire l’adaptation des forêts à des environnements changeants sur la base de ces connaissances. Le bois est un tissu essentiel pour l’arbre, assurant différentes fonctions physiologiques (mécanique, hydraulique, réserves), indispensables pour son développement et sa pérennité. Les propriétés du bois se mettent en place au cours de la xylogenèse, sous contrôle de facteurs génétiques et environnementaux.

Vous mettrez en place un projet de biologie intégrative pour produire des connaissances sur les mécanismes moléculaires impliqués dans la xylogenèse sous contraintes environnementales multiples, mimant les effets du changement climatique. Vous analyserez comment le cambium, méristème secondaire à l’origine des cellules de bois, perçoit et répond aux conditions environnementales. Vous identifierez les mécanismes moléculaires mis en jeu plus spécifiquement dans la plasticité adaptative du fonctionnement cambial, ainsi que les compromis entre les différentes fonctions physiologiques du bois. Ce projet sera développé prioritairement sur le peuplier, une essence d’intérêt économique et un arbre forestier modèle largement utilisé à BioForA et au niveau international. A moyen terme, il pourra être envisagé des approches similaires sur le mélèze à titre comparatif chez les conifères à la structure et aux propriétés du bois différentes.

Pour répondre à ces questions de recherche, vous développerez des dispositifs expérimentaux permettant de suivre la xylogenèse sous contraintes environnementales multiples. Votre projet de recherche s’appuiera sur l’analyse du transcriptome à l’échelle cellulaire (séquençage Single Cell) et sur le phénotypage à moyen débit des propriétés anatomiques, chimiques et mécaniques du bois. Celles-ci pourront être évaluées par diverses méthodes innovantes de microscopie et d’analyses d’image (notamment par imagerie hyperspectrale infra-rouge pour analyser in situ les composants des parois cellulaires). Vous intégrerez ces données pour construire des réseaux de gènes expliquant le fonctionnement du cambium en fonction des différentes contraintes appliquées. Vous vous appuierez sur les méthodes d’édition des génomes afin de concevoir des lignées de peupliers éditées permettant de perturber ces réseaux de gènes. Vous chercherez ainsi à établir des relations causales directes entre polymorphisme génétique créé par édition, variations d’expression dans les réseaux et variations du phénotype.

Pour initier votre projet, vous bénéficierez de données multi-omiques déjà obtenues par BioForA qui pourront guider le choix de gènes candidats à privilégier dans votre projet, ainsi que de méthodes innovantes d’édition des génomes et de microphénotypage. Vous pourrez vous appuyer sur une équipe de collègues experts en physiologie de la formation du bois, édition des génomes, génétique quantitative et des populations, statistiques et bio-informatique, sur un partenariat établi de collaborateurs nationaux et européens et sur des réseaux multidisciplinaires d’animation (GDR Sciences du Bois, Réseau Français des Parois). Vous bénéficierez de l’accès sur site au Laboratoire d’Ingénierie Cellulaire de l’Arbre (LICA), pour toute expérience en milieu confiné, et à la plateforme Phénobois de phénotypage des propriétés du bois.

Les expérimentations sur peupliers transgéniques ou édités auront lieu au LICA, bâtiment combiné laboratoire/serre L2S2, dans le respect des règles de biosécurité. Pour plus d’informations : https://www6.inrae.fr/lica/

Formations et compétences recherchées

Doctorat ou équivalent

Une spécialité en génomique fonctionnelle et biologie du développement et/ou en biologie intégrative est souhaitée.

Des compétences en biologie moléculaire, biologie cellulaire et physiologie seront appréciées.

La maîtrise de l’anglais est souhaitée ainsi qu’une expérience internationale de longue durée : les lauréats qui n’en auraient pas encore eu devront réaliser un séjour à l’étranger à l’issue de l’année de stage.

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Votre qualité de vie à INRAE

En Rejoignant INRAE, Vous Bénéficiez

• de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• d’un soutien à la parentalité : CESU garde d’enfants, prestations pour les loisirs ;
• de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• d’un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
• d’activités sportives et culturelles ;
• d’une restauration collective.

Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE

Modalités pour postuler

• Je télécharge le guide Guide des candidats CRCN 2025 pdf – 3.72 MB
• Je note le numéro du profil CR-2025-ECODIV-3
• Je m’inscris Inscription

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr